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何勇宁
研究员
E-mail: he@@sibcb.ac.cn


个人简介

1991年毕业于复旦大学获学士学位,1994年在复旦大学获硕士学位。2002年在美国普渡大学(Purdue University)获生物化学与分子生物学博士学位。2003至2011年在美国加州理工学院(California Institute of Technology, Caltech)从事博士后研究,后任Staff Scientist。2011年6月起任中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员、研究组长。


研究方向

细胞表面受体的结构与功能


研究工作

研究组主要运用多种结构生物学,包括电子显微镜三维重构(单颗粒重构、断层成像等)、蛋白质结晶学等方法,并结合分子和细胞生物学手段,研究细胞表面受体的结构以及受体配体之间、病毒与受体之间、细胞之间的相互作用和信号传递。目前工作主要集中在以下三个方向。
 
1)免疫受体的结构与调控机制
免疫系统对个体的生存有着重要意义。免疫应答非常复杂但又有着严格的调控,需要不同的表面受体参与识别和应答。我们主要针对抗原呈递细胞(如树突状细胞、巨噬细胞等)等吞噬细胞表面的免疫受体,进行系统性的结构研究,以弄清其免疫识别和调控的分子机制。
 
2)表面受体介导的细胞相互作用
受体分子广泛分布于各种类型的细胞表面,介导细胞间的识别和信息传递,并参与细胞生长、迁移、分化等重要过程。我们主要通过电镜三维重构技术,并结合蛋白质结晶学和相应的细胞生物学方法,研究受体在细胞表面的原位或准原位结构和相互作用细节,以获得受体介导的细胞相互作用的分子机制和调控模式,进而深入理解相关的生理过程。
 
3)细胞受体与病毒侵染
细胞表面受体除了具有自身的生理学功能外,还可能被外界病原体如病毒等用于入侵细胞的受体。我们主要通过电镜三维重构技术,研究受体与病毒的相互作用,以及病毒在侵染过程中的结构变化,从而理解病毒入侵细胞的分子机制,为抗病毒策略以及药物和疫苗设计提供理论依据。


代表性论文

  1. Cao, L.,Chang, H.,Shi, X., Peng, Ch., He, Y.*, (2016).Keratin mediates the recognition of apoptotic and necrotic cells through dendritic cell receptor DEC205/CD205 .Proc Natl Acad Sci USA ,113,47,13438-13443
  2. Cao, L., Shi, X., Chang, H., Zhang, Q., He, Y.*, (2015). pH-dependent recognition of apoptotic and necrotic cells by the human dendritic cell receptor DEC205. Proc Natl Acad Sci USA 112,23,7237-7242
  3. He, W., He, Y., (2014). Electron tomography for organelles, cells, and tissues. Methods Mol Biol. 1117, 445-83.
  4. He, Y., Bjorkman, P.J., (2011). Structural of FcRY, an avian immunoglobulin receptor related to mammalian mannose receptors, and its complex with IgY. Proc Natl Acad Sci USA 108, 12431-6
  5. He, Y., Olson, R., (2010). Three-dimensional structure of the detergent-solubilized Vibrio cholerae cytolysin (VCC) heptamer by electron cryomicroscopy, J Struct Biol. 169, 6-13. (Co-first authors).
  6. He, Y., Jensen, G.J., Bjorkman, P.J., (2009). Nanogold as a specific marker for electron cryotomography, Microsc Microanal. 15, 183-188. (*Selected as the best biological paper in Microscopy and Microanalysis in 2009.)
  7. He, Y., Jensen, G.J., Bjorkman, P.J., (2009). Cryo-electron tomography of homophilic adhesion mediated by the neural adhesion molecule L1. Structure 17, 460-471.
  8. He, Y., Mueller S., Chipman, P.C., Bator, C.M., Peng, X., Bowman, V.D., Mukhopadhyay, S., Wimmer, E., Kuhn, R.J., Rossmann, M.G., (2003). Complexes of poliovirus serotypes with their common cellular receptor, CD155. J Virol. 77, 4827-4835.
  9. Rossmann, M.G., He, Y., Kuhn, R.J., (2002). Picornavirus receptor interactions. Trends Microbiol. 10, 324-331.
  10. He, Y., Lin, F., Chipman, P.R., Bator, C.M., Baker, T.S., Shoham, M., Kuhn, R.J., Medof, M.E., Rossmann, M.G., (2002). Structure of decay-accelerating factor bound to echovirus 7: a virus-receptor complex. Proc Natl Acad Sci USA 99, 10325-10329.
  11. He, Y., Chipman, P.R., Howitt, J., Bator, C.M., Whitt, M., Baker, T.S., Kuhn, R.J., Anderson, C.W., Freimuth, P., Rossmann, M.G., (2001). Interaction of coxsackievirus B3 with the full-length coxsackievirus-adenovirus receptor. Nature Struct Biol. 8, 874-878.
  12. He, Y., Bowman, V.D., Mueller, S., Bator, C.M., Bella, J., Peng, X., Baker, T.S., Wimmer, E., Kuhn, R.J., Rossmann, M.G., (2000). Interaction of the poliovirus receptor with poliovirus. Proc Natl Acad Sci USA 97, 79-84.
  13. Xia, Z., He, Y., Dai, W., White, S.A., Boyd, G.D., Mathews, F.S., (1999). Detailed active site configuration of a new crystal form of methanol dehydrogenase from Methylophilus W3A1 at 1.9Å resolution. Biochemistry. 38, 1214-1220.
  14. He, Y., Xia, Z., Wang, Y., Ji, Y., Yeh. M., (1996). Prediction of antigenic determinants of trichosanthin by molecular modeling. Cell Research. 6, 93-100.
  15. He, Y., Shen, X., Ma, L., (1996). Synthesis and characterization of nanometer-sized zinc oxide. Chinese J Appl Chem. 13, 92-94.

研究组成员

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